1、感染問題
早產兒因免疫系統尚未發育完全，較沒有對抗病毒的能力，非常容易受感染，而且一旦感染很容易造成敗血癥，甚至于腦膜炎，需要特別注意。
2、心血管疾病
若早產兒肺部問題逐漸好轉時，會因動脈導管尚未關閉，而有多的血量自主動脈經由動脈導管流至肺，造成心臟衰竭及肺功能變差。
3、呼吸系統疾病
因早產兒的肺部發育不全，因此會造成呼吸困難，甚至呼吸衰竭。部分體重極低的寶寶也會有呼吸窘迫癥候群，而有呼吸急促、發紺的現象。
4、腸胃系統疾病
早產兒容易有營養吸收不良的毛病，因此最好喂以母奶;即使不得已要以配方奶替代，也最好采取少量漸近式的喂食方式。此外，有極少部份的早產兒會發生壞死性腸炎，需要特殊的治療。
5、視網膜病變
早產可能導致視網膜新生血管的正常發育受阻，而造成眼部發育不良，較易有近視等問題，應至兒童眼科追蹤檢查。
6、周腦室及腦室內出血
因早產兒腦室構造不成熟，血管構造相當脆弱，很容易易因腦壓升高，而破裂出血。一般可分為四級，若是輕微出血，且未造成腦室擴大，多半會由腦自行吸收。但是若因大量出血，造成腦室擴大或擴及腦組織，就有可能影響神經功能，造成動作發展遲緩或行為障礙。應于出生后，作腦部超音波，若有問題則需定期追蹤檢查。